ARN ribozomal 18S - 18S ribosomal RNA

ARN ribozomal 18S (prescurtat ARNr 18S ) este o parte a ARN ribozomal . S în 18S reprezintă unități Svedberg . ARNr 18S este un ARNr SSU , o componentă a subunității mici ribozomale eucariote ( 40S ). ARNr 18S este ARN structural pentru componenta mică a ribozomilor citoplasmatici eucariote și, prin urmare, una dintre componentele de bază ale tuturor celulelor eucariote.

ARNr 18S este omologul citosolic eucariot al ARN ribozomal 16S din procariote și mitocondrii .

Genele care codifică ARNr 18S sunt denumite gene ARNr 18S . Datele secvențiale din aceste gene sunt utilizate pe scară largă în analiza moleculară pentru reconstituirea istoriei evolutive a organismelor, în special la vertebrate, deoarece rata sa evolutivă lentă îl face potrivit pentru reconstituirea divergențelor antice.

Utilizări în filogenie

Gena ARNr 18S subunitate mică (SSU) este una dintre cele mai frecvent utilizate gene în studiile filogenetice și un marker important pentru reacția în lanț polimerază țintă aleatorie (PCR) în screeningul biodiversității de mediu. În general, secvențele genei ARNr sunt ușor de accesat datorită regiunilor de flancare foarte conservate care permit utilizarea primerilor universali . Aranjamentul lor repetitiv în cadrul genomului asigură cantități excesive de ADN șablon pentru PCR, chiar și în cele mai mici organisme. Gena 18S face parte din nucleul funcțional ribozomal și este expusă la forțe selective similare la toate ființele vii. Astfel, când au fost publicate primele studii filogenetice la scară largă bazate pe secvențe 18S (de exemplu, de Field și colab. , 1988), gena a fost sărbătorită ca fiind primul candidat pentru reconstrucția arborelui metazoan al vieții . 18S secvențe de mai târziu , a furnizat probe pentru divizarea ecdysozoa și Lophotrochozoa încrengături (grupul monofiletic de organisme compuse dintr - un strămoș comun și toți descendenții săi direcți), contribuind astfel la cea mai recenta schimbare revoluționară în înțelegerea relațiilor metazoare.

Cu toate acestea, în ultima parte a anilor 2000 și cu un număr crescut de taxoni incluși în filogenii moleculare, au apărut două probleme. În primul rând, există impedimente predominante în secvențiere reprezentanții anumitor taxoni, cum ar fi clasele mollusk Solenogastres și Tryblidia , selectat bivalva taxonomică, și clasa crustaceelor enigmatica Remipedia . Eșecul obținerii secvențelor 18S ale taxonilor unici este considerat un fenomen comun, dar este rar raportat vreodată. În al doilea rând, spre deosebire de speranțele mari inițiale, 18S nu poate rezolva nodurile la toate nivelurile taxonomice, iar eficacitatea acestuia variază considerabil între clade. Acest lucru a fost discutat ca efect al radiațiilor antice rapide în perioade scurte. Analizele multigene sunt considerate în prezent că oferă rezultate mai fiabile pentru urmărirea evenimentelor de ramificare profundă în Metazoa, dar 18S este încă utilizat pe scară largă în analizele filogenetice.

Referințe

Acest articol încorporează text CC-By-2.0 din referință.