Asgard (archaea) - Asgard (archaea)
| Asgard | |
|---|---|
Clasificare științifică 
|
|
| Domeniu: | Archaea |
| Regatul: | Proteoarchaeota |
| Superphylum: |
Asgard (Archaea) Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka , și colab. 2017 |
| Phyla | |
|
|
|
|
| Sinonime | |
|
|
Asgard sau Asgardarchaeota este propusă superphylum constând dintr - un grup de Archaea care include Lokiarchaeota , Thorarchaeota , Odinarchaeota și Heimdallarchaeota . Un reprezentant al grupului a fost cultivat. Superfilul Asgard reprezintă cele mai apropiate rude procariote ale eucariotelor , care au apărut posibil dintr-o descendență ancestrală a Asgardarchaeota după asimilarea bacteriilor prin procesul de simbiogeneză .
Descoperire
În vara anului 2010 , au fost analizate sedimentele dintr-un miez gravitațional preluat în valea riftului de pe creasta Knipovich din Oceanul Arctic, în apropierea așa-numitului sit de ventilație hidrotermală a Castelului Loki . Orizonturile specifice de sedimente arătate anterior conținând abundențe mari de linii arheologice noi, au fost supuse analizei metagenomice .
În 2015, o echipă condusă de Universitatea Uppsala a propus filul Lokiarchaeota pe baza analizelor filogenetice utilizând un set de gene care codifică proteinele foarte conservate . Printr-o referire la complexul de ventilație hidrotermală din care a provenit primul eșantion de genom, numele se referă la Loki , zeul nordic care schimbă forma. Loki mitologic a fost descris ca „o figură uimitor de complexă, confuză și ambivalentă, care a fost catalizatorul a nenumărate controverse științifice nerezolvate”, analog rolului Lokiarchaeota în dezbaterile despre originea eucariotelor.
În 2016, o echipă condusă de Universitatea Texas a descoperit Thorarchaeota din eșantioane prelevate din râul White Oak din Carolina de Nord, numit în referință la Thor , un alt zeu nordic.
Eșantioane suplimentare din Castelul Loki, Parcul Național Yellowstone , Golful Aarhus , un acvifer în apropierea râului Colorado , piscina Radiata din Noua Zeelandă , gurile de ventilare hidrotermale lângă insula Taketomi , Japonia și estuarul râului White Oak din Statele Unite au condus cercetătorii să descopere Odinarchaeota și Heimdallarchaeota , și după ce convenția de numire a fost stabilită pentru a folosi zeități nordice, archaea a fost numită pentru Odin și , respectiv, Heimdallr . Prin urmare, cercetătorii au numit superfilumul care conține acești microbi „ Asgard ”, după tărâmul zeităților din mitologia nordică.
Descriere
Membrii Asgard codifica mai multe proteine de semnătură eucariote , inclusiv GTPases roman, proteine-remodelare cu membrana ca ESCRT și SNF7 , un ubiquitinei sistem modificator și N-glicozilare Omologii cale.
Arheonii Asgard au un citoschelet de actină reglat , iar profilinele și gelsolinele pe care le folosesc pot interacționa cu actinele eucariote. De asemenea, par să formeze vezicule sub microscopie electronică criogenică . Unele pot avea un strat S de domeniu PKD . Aceștia împărtășesc, de asemenea, expansiunea ES39 cu trei căi în ARNr LSU cu eucariote.
Metabolism
Căi metabolice ale arheilor Asgard, variație de Phyla
Căi metabolice ale arheilor Asgard, variație în funcție de mediu
Archaea Asgard este, în general , anaerobe obligatorii , deși Kariarchaeota, Gerdarchaeota și Hodarchaeota pot fi aerobi facultativi . Au o cale Wood-Ljungdahl și efectuează glicoliză . Membrii pot fi autotrofi , heterotrofi sau fototrofi utilizând heliorodopsină . Un membru, Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum , efectuează sintrofia cu o proteobacterie care reduce sulf și o arheea metanogenă .
RUBISCO ei au nu-carbon de fixare, dar probabil utilizat pentru nucleozid salvatoare.
Caracteristici asemănătoare eucariotei în subdiviziuni
Filul „Heimdallarchaeota” s-a dovedit a avea cozi de histone ale nucleului N-terminal, o caracteristică care anterior se credea exclusiv eucariotă, în 2017. Alte două filuri arhaeale, ambele în afara Asgard, s-au dovedit a avea și cozi în 2018.
În ianuarie 2020, oamenii de știință au găsit Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum , membru al Lokiarcheota, angajându -se în hrănirea încrucișată cu două specii bacteriene. Trăind o analogie cu simbiogeneza , ei consideră această relație o posibilă legătură între microorganismele procariote simple și microorganismele eucariote complexe care apar acum aproximativ două miliarde de ani.
Clasificare
Relația filogenetică a acestui grup este încă în discuție. Relația membrilor este aproximativ după cum urmează:
|
Asgard
|
Unii autori au sugerat să împartă Heimdallarchaeota în mai multe grupuri (Hodarchaeota, Gerdarchaeota, Kariarchaeota și Heimdallarchaeota). Eucariotele pot fi sora celor patru grupuri anterioare și a Wukongarchaeota, sau a întregului grup archaea Asgard. Un scenariu favorizat este sintrofia, în care un organism depinde de hrănirea celuilalt. În acest caz, sintrofia se poate datora faptului că arheele Asgard au fost încorporate într-un tip necunoscut de bacterii, dezvoltându-se în nucleu. O α-proteobacterie a fost încorporată pentru a deveni mitocondria .
Referințe
linkuri externe
- Traci Watson: Microbii șmecheri care scutură arborele vieții , în: Natura , 14 mai 2019