Betacoronavirus -Betacoronavirus

Betacoronavirus
Micronografia electronică a virusului coronavirus murin, structura schematică și genomul
Micrografia electronică a virionului coronavirus murin (MHV), structură schematică și genom
Clasificarea virușilor e
(nereclasat): Virus
Tărâm : Riboviria
Regatul: Orthornavirae
Phylum: Pisuviricota
Clasă: Pisoniviricete
Ordin: Nidovirale
Familie: Coronaviridae
Subfamilie: Orthocoronavirinae
Gen: Betacoronavirus
Subgenuri și specii

Vezi textul

Betacoronavirusul (β-CoVs sau Beta-CoVs) este unul dintre cele patru genuri ( Alpha -, Beta- , Gamma- și Delta- ) de coronavirusuri . Virușii membri sunt viruși ARN înveliți , cu catenă pozitivă ,care infectează mamiferele (din carefac parte oamenii ). Rezervorul natural pentru betacoronaviruses sunt lilieci și rozătoare. Rozătoarele sunt rezervorul pentru subgenul Embecovirus , în timp ce liliecii sunt rezervorul pentru celelalte subgenuri.

Genurile de coronavirus sunt compuse fiecare din linii virale variate, cu genul betacoronavirus care conține patru astfel de linii: A, B, C, D. În literatura mai veche, acest gen este, de asemenea, cunoscut sub numele de "coronavirusuri din grupa 2". Genul se află în subfamilia Orthocoronavirinae din familia Coronaviridae , din ordinul Nidovirales .

Betacoronavirusurile cu cea mai mare importanță clinică în ceea ce privește oamenii sunt OC43 și HKU1 (care poate provoca răceala obișnuită ) din linia A, SARS-CoV și SARS-CoV-2 (care cauzează boala COVID-19 ) din linia B și MERS- CoV al liniei C. MERS-CoV este primul betacoronavirus aparținând liniei C despre care se știe că infectează oamenii.

Etimologie

Numele „betacoronavirus” este derivat din greaca veche βῆτα ( bē̂ta , „a doua literă a alfabetului grecesc ”) și κορώνη (korṓnē, „ghirlandă, coroană”), care înseamnă coroana, care descrie aspectul proiecțiilor de suprafață microscopie electronică care seamănă cu o coroană solară . Această morfologie este creată de viral Spike (S) peplomers , care sunt proteine care populează suprafața virusului și determină tropism gazdă . Ordinul Nidovirales este numit pentru latina nidus , care înseamnă „cuib”. Se referă la producerea acestui ordin a unui set cuibinal 3'-coterminal de ARNm subgenomici în timpul infecției.

Structura

MERS-CoV: structură, atașament, intrare și compoziție genomică

Au fost rezolvate mai multe structuri ale proteinelor spike. Domeniul de legare a receptorilor din proteina vârf alfa și betacoronavirus este catalogat ca InterProIPR018548 . Proteina spike, o mașină de fuziune tip 1 , se asamblează într-un trimer ( PDB : 3jcl , 6acg ); structura sa de bază seamănă cu cea a proteinelor F (fuziune) ale paramixovirusului . Utilizarea receptorilor nu este foarte conservată; de exemplu, printre Sarbecovirus , doar o sub-linie care conține SARS are în comun receptorul ACE2 .

Virușii subgenului Embecovirus diferă de toți ceilalți din gen prin faptul că au o proteină suplimentară mai scurtă (8 nm) asemănătoare vârfului, numită hemagglutinin esterază (HE) ( P15776 ). Se crede că au fost achiziționate de la virusul gripal C .

Genomul

Genomi de alphacoronaviruses și betacoronaviruses

Coronavirusurile au o dimensiune mare a genomului care variază între 26 și 32 kilobaze. Structura generală a genomului β-CoV este similară cu cea a altor CoV, cu o poliproteină replicază ORF1ab ( rep , pp1ab ) precedând alte elemente. Această poliproteină este clivată în 16 proteine ​​nestructurale (vezi adnotarea UniProt a reprezentantului SARS , P0C6X7 ).

Începând cu mai 2013, GenBank a publicat 46 de genomi completi ai α- (grupului 1), β- (grupului 2), γ- (grupului 3) și δ- (grupului 4) CoV.

Recombinarea

Recombinarea genetică poate apărea atunci când doi sau mai mulți genomi virali sunt prezenți în aceeași celulă gazdă. Dromader cămilă Beta-CoV HKU23 prezintă diversitate genetică în populația africană cămilă. La această diversitate contribuie mai multe evenimente de recombinare care avuseseră loc în trecut între betacoronavirusurile înrudite din subgenul Embecovirus . De asemenea, betacoronavirusul, SARS-CoV uman , pare să fi avut o istorie complexă de recombinare între coronavirusuri ancestrale care au fost găzduite în mai multe grupuri diferite de animale.

Patogenie

Ciclul de replicare a virușilor din genul Betacoronavirus

Alfa și betacoronavirusurile infectează în principal liliecii, dar infectează și alte specii, cum ar fi oamenii , cămilele și rozătoarele . Betacoronavirusurile care au cauzat epidemii la oameni induc, în general, febră și simptome respiratorii. Ei includ:

Clasificare

Arborele filogenetic al descendențelor genului Betacoronavirus cu detalii pentru SARS-CoV și MERS-CoV

În cadrul genului Betacoronavirus (Grupa 2 CoV), patru subgenuri sau linii (A, B, C și D) au fost recunoscute în mod tradițional. Cele patru linii au fost, de asemenea, numite folosind litere grecești sau numeric. Un al cincilea subgen, Hibecovirus , a fost adăugat mai recent. Subgenurile și speciile membre includ:

Embecovirus (linia A)

Betacoronavirus 1

China Rattus coronavirus HKU24
Coronavirus uman HKU1
Coronavirus murin

Myodes coronavirus 2JL14

Sarbecovirus (linia B)

Coronavirusul legat de sindromul respirator acut sever (SARSr-CoV sau SARS-CoV)

Merbecovirus (linia C)

Hedgehog coronavirus 1
Orientul Mijlociu coronavirus asociat sindromului respirator (MERS-CoV)
Pipistrellus bat coronavirus HKU5
Tylonycteris bat coronavirus HKU4

Nobecovirus (linia D)

Eidolon liliac coronavirus C704
Rousettus liliac coronavirus GCCDC1
Rousettus liliac coronavirus HKU9

Hibecovirus

Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013

Vezi si

Referințe

linkuri externe