Caudovirales -Caudovirales

Caudovirales
Caudovirales.svg
De la stânga la dreapta: Myoviridae , Podoviridae și Siphoviridae
Clasificarea virușilor e
(neclasificat): Virus
Tărâm : Duplodnaviria
Regatul: Heunggongvirae
Phylum: Uroviricota
Clasă: Caudoviricete
Ordin: Caudovirales
Familii

Vezi textul

Structura bacteriofagelor cu coadă: (1) cap, (2) coadă, (3) ADN, (4) capsidă, (5) guler, (6) teacă, (7) fibre de coadă, (8) vârfuri, (9) placă de bază
Micrografie electronică de transmisie a Gamma-Phage
Ilustrații ale diferitelor caudovirale . Nu la scară.

Caudovirales este un ordin de viruși cunoscut sub numele de bacteriofagi cu coadă ( cauda este latină pentru "coadă"). Conformschemei de clasificare Baltimore , Caudoviralele sunt virusuri din grupa I, deoarece augenomuri de ADN dublu catenar(ADNd), care pot fi de la 18.000 de perechi de baze la 500.000 de perechi de baze în lungime. Particulele virusului au o formă distinctă; fiecare virion are uncap icosaedric care conține genomul viral și este atașat la o coadă flexibilă de o proteină conector. Ordinea cuprinde o gamă largă de viruși, mulți conținând gene de secvență și funcție de nucleotide similare. Cu toate acestea, unele genomi de bacteriofagi cu coadă pot varia destul de semnificativ în secvența de nucleotide, chiar și în același gen. Datorită structurii lor caracteristice și posesiagenelorpotențial omoloage , se crede că acești bacteriofagi posedă o origine comună.

Există 14 familii, 73 de subfamilii, 927 de genuri și 2.814 specii în această ordine. Acest lucru face ca Caudovirales să fie cea mai populată ordine dintre viruși, reprezentând aproximativ 30% din toate speciile de virus recunoscute și aproape jumătate din toate genurile de virus.

Infecţie

La întâlnirea unei bacterii gazdă, secțiunea cozii virionului se leagă de receptorii de pe suprafața celulei și livrează ADN-ul în celulă prin utilizarea unui mecanism asemănător injectizomului (un injectizom este o nanomașină care a evoluat pentru eliberarea proteinelor de tipul III secreție ). Secțiunea cozii virusului străpunge o gaură prin peretele celular bacterian și membrana plasmatică, iar genomul trece pe coadă în celulă. Odată ajunși în interior, genele sunt exprimate din transcrierile făcute de mașina gazdă, folosind ribozomi gazdă . De obicei, genomul este reprodus prin utilizarea concatemerilor , în care sunt realizate segmente suprapuse de ADN, și apoi puse împreună pentru a forma întregul genom.

Asamblare și maturare

Proteinele capsidei virale se reunesc pentru a forma un cap precursor , în care intră genomul. Odată ce acest lucru a avut loc, prohead-ul suferă o maturare prin scindarea subunităților capsidale pentru a forma un cap de fag icosaedric cu simetrie de 5 ori. După maturarea capului, coada este unită în unul din cele două moduri: Fie coada este construită separat și unită cu conectorul, fie coada este construită direct pe capul fagului. Cozile constau din proteine ​​pe bază de helix cu simetrie de 6 ori. După maturarea particulelor de virus, celula este lizată de lizine , holine sau o combinație a celor două.

Taxonomie

Din cauza lipsei de omologie între secvențele de aminoacizi și ADN ale acestor viruși, acești factori sunt împiedicați să fie utilizați ca markeri taxonomici, așa cum este obișnuit pentru alte organisme, cele trei familii discutate mai jos ( Myoviridae , Podoviridae și Siphoviridae ) sunt definite pe baza morfologiei . Această schemă de clasificare a fost inițiată de Bradley în 1969 și a fost extinsă de atunci.

Toți virușii din această ordine au capete icosaedrice sau oblate, dar diferă prin lungimea și abilitățile contractile ale cozilor lor. Myoviridae au cozi lungi , care sunt contractile; Podoviridae au cozi scurte noncontractile; iar Siphoviridae au cozi lungi necontractile. Siphoviridae constituie majoritatea virusurilor cunoscute.

Bradley s-a referit la ceea ce este acum cunoscut sub numele de Myoviridae ca tip A, Siphoviridae ca tip B și Podoviridae ca tip C. El și-a împărțit grupurile pe baza morfologiei capului: în cadrul grupului A, A1 au capete izometrice mici; A2 au capete prolate; și A3 au capete alungite. În cadrul grupurilor B și C, numerele au fost atribuite în mod similar: B1 și C1 au capete izometrice mici; B2 și C2 au capete prolate; iar B3 și C3 au capete alungite.

În plus, cele trei familii menționate anterior, un total de 14 familii și un gen incertae sedis sunt alocate ordinului:

Evoluția bacteriofagului

Bacteriofagii apar la peste 195 de genuri bacteriene sau arhaeale. Au apărut în mod repetat în diferite gazde și există cel puțin 11 linii separate de coborâre. Peste 6300 de bacteriofagi au fost examinați la microscopul electronic din 1959. Dintre aceștia, peste 96% au cozi. Dintre fagii cu coadă, aproximativ 57% au cozi lungi, necontractile ( Siphoviridae ). Fagii cu coadă par a fi monofiletici și sunt cel mai vechi grup de virusuri cunoscut.

Vezi si

Referințe

Lecturi suplimentare