EGR1 - EGR1

EGR1
Structuri disponibile
PDB	Căutare Ortholog : PDBe RCSB
Lista codurilor de identificare PDB
	4R2A , 4R2C , 4R2D , 4X9J
Identificatori
Aliasuri	EGR1 , AT225, G0S30, KROX-24, NGFI-A, TIS8, ZIF-268, ZNF225, răspuns de creștere timpuriu 1
ID-uri externe	OMIM : 128990 MGI : 95295 HomoloGene : 56394 GeneCards : EGR1
Localizarea genei ( uman )
Chr.	Cromozomul 5 (uman)
Sfârșit	138.469.303 bp
Model de expresie ARN
	; ;
	Mai multe date de expresie de referință
Ontologia genică
Funcția moleculară	• ADN de legare ; • ADN secvență specifică de legare ; • ARN polimerazei II transcrierii regiune specifică secvenței de legare a ADN - ului ; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 activității factorului de transcripție de legare a ADN - ului ; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Activarea activatorului de transcripție de legare a ADN-ului, specific ARN polimerază II ; • GO: 0000975 transcriere legarea regiunii cis-reglare ; • legarea ionilor metalici ; • activitatea factorului de transcripție, promotor central al ARN polimerazei II regiune de legare a secvenței specifice ; • GO: legarea 0001948 proteină ; • histone acetiltransferaza de legare ; • legare a acidului nucleic ; • hemi-metilat de legare a ADN - ului ; • dublu catenar de legare ADN metilat ; • zinc ion de legare ; • promotor specific de legare a cromatinei ; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Activitatea factorului de transcripție de legare a ADN-ului, specific ARN polimerazei II;
Componentă celulară	• nucleoplasmă ; • nucleu ; • citoplasmă;
Proces biologic	• reglarea procesului apoptotic ; • răspunsul celular la substanța organică ; • reglarea transcripției, modelat de ADN ; • proliferarea celulelor glomerulare mezangiale ; • reglarea negativă a transcripției prin ARN polimeraza II ; • răspuns la glucoză ; • transcrierea prin ARN polimeraza II ; • Calea de semnalizare BMP ; • transcrierea, Modelat de ADN ; • reglare pozitivă a transcripției, modelat de ADN ; • răspuns la insulină ; • cale de semnalizare mediată de interleukină-1 ; • răspuns celular la acidul micofenolic ; • Diferențierea celulelor T ; • cale de semnalizare a interferonului de tip I ; • reglarea pozitivă a proliferării celulelor mesangiale metanefrice glomerulare ; • răspunsul celular la radiații gamma ; • reglarea transcripției din promotorul ARN polimerazei II ca răspuns la hipoxie ; • diferențierea celulelor musculare scheletice ; • răspunsul celular la heparină ; • reglarea sumoilării proteinelor ; • reglarea negativă a căii de semnalizare Wnt canonice ; • reglarea pozitivă a transcripției prin ARN polimeraza II ; • respon celular se la interleukina-8 ; • răspuns la hipoxie ; • răspuns la ischemie ; • ciclu estru ; • reglarea pozitivă a procesului biosintetic hormonal ; • reglarea procesului biosintetic al progesteronului ; • reglarea transcripției prin ARN polimeraza II ; • reglarea pozitivă a expresiei genice ; • reglarea circadiană a expresiei genice ; • ritm locomotor ; • proces ritmic ; • temperatura homeostaziei circadiene ; • reglarea pozitivă a morții neuronilor ; • reglarea pozitivă a activității tau-protein kinazei;
	Surse: Amigo / QuickGO
Orthologs
	1958
	13653
	ENSG00000120738
	ENSMUSG00000038418
	P18146
	P08046
	NM_001964
	NM_007913
	NP_001955
	NP_031939
	Wikidata
Vizualizare / Editare umană	Vizualizați / Editați mouse-ul

EGR-1 (proteina de răspuns la creștere timpurie 1) cunoscută și sub numele de ZNF268 (proteina degetului de zinc 268) sau NGFI-A (proteina A indusă de factorul de creștere a nervului) este o proteină care la om este codificată de gena EGR1 .

EGR-1 este un factor de transcripție la mamifere . De asemenea, a fost numit Krox-24, TIS8 și ZENK . A fost descoperit inițial la șoareci .

Funcţie

Proteina codificată de această genă aparține familiei EGR a proteinelor degetului de zinc de tip ₂ Cys ₂ His . Este o proteină nucleară și funcționează ca un regulator transcripțional. Produsele genelor țintă pe care le activează sunt necesare pentru diferențiere și mitogeneză . Studiile sugerează că aceasta este o genă supresoare tumorale .

Are un model distinct de exprimare în creier, iar inducția sa s-a dovedit a fi asociată cu activitatea neuronală. Mai multe studii sugerează că are un rol în plasticitatea neuronală .

EGR-1 este un factor important de transcripție în formarea memoriei . Are un rol esențial în reprogramarea epigenetică a neuronilor cerebrali . EGR-1 recrutează proteina TET1 care inițiază o cale de demetilare a ADN-ului . Eliminarea semnelor de metilare a ADN-ului permite activarea genelor din aval. EGR-1, împreună cu TET1, este utilizat în programarea distribuției siturilor de metilare pe ADN-ul creierului în timpul dezvoltării creierului, în învățare și în plasticitatea neuronală pe termen lung . S-a descoperit că EGR-1 reglează expresia VAMP2 (o proteină importantă pentru exocitoza sinaptică ).

Pe lângă funcția sa în sistemul nervos, există dovezi semnificative că EGR-1 împreună cu paralogul său EGR-2 este indus în bolile fibrotice are funcții cheie în fibrinogeneză și este necesar pentru fibroza indusă experimental la șoareci.

Poate fi, de asemenea, implicat în funcția ovariană

Structura

Domeniul de legare a ADN-ului EGR-1 constă din trei domenii deget de zinc de tip Cys ₂ His ₂ . Structura aminoacizilor din domeniul degetului de zinc EGR-1 este dată în acest tabel, utilizând codul de aminoacizi cu o singură literă. Degetele de la 1 la 3 sunt indicate de f1 - f3. Numerele fac referire la reziduurile (aminoacizii) alfa helix (nu există zero). Reziduurile marcate cu „x” nu fac parte din degetele de zinc, ci servesc mai degrabă pentru a le conecta pe toate împreună.


																				-1	1	2	3	4	5	6	7	8	9			X	X	X	X	X
f1	M	A	E	E	R	P	Da	A	C	P	V	E	S	C	D	R	R	F	S	R	S	D	E	L	T	R	H	Eu	R	Eu	H	T	G	Î	K	P
f2							F	Î	C	A	Eu	-	-	C	M	R	N	F	S	R	S	D	H	L	T	T	H	Eu	A	T	H	T	G	E	K	P
f3							F	A	C	D	Eu	-	-	C	G	R	K	F	A	R	S	D	E	R	K	R	H	T	K	Eu	H	L	R	Î	K	D

Cheie de aminoacizi: Alanină (Ala, A), Arginină (Arg, R), Asparagină (Asn, N), Acid aspartic (Asp, D), Cisteină (Cys, C), Acid glutamic (Glu, E), Glutamină ( Gln, Q), Glicină (Gly, G), Histidină (His, H), Isoleucină (Ile, I), Leucina (Leu, L), Lizină (Lys, K), Metionină (Met, M), Fenilalanină (Phe , F), Proline (Pro, P), Serine (Ser, S), Treonine (Thr, T), Triptofan (Trp, W), Tirozină (Tyr, Y), Valine (Val, V)

Structura cristalină a ADN-ului legat de domeniul degetului de zinc al EGR-1 a fost rezolvată în 1991, ceea ce a ajutat foarte mult cercetarea timpurie în domeniile de legare a ADN-ului degetului de zinc.

Proteina EGR-1 umană conține (în forma sa neprelucrată) 543 aminoacizi cu o greutate moleculară de 57,5 kDa , iar gena este localizată pe cromozomul 5 .

Specificitatea legării ADN-ului

EGR-1 leagă secvența ADN 5'-GCG TGG GCG-3 '(și altele similare precum 5'-GCG GGG GCG-3'). Poziția f1 6 leagă 5 'G (primul număr de bază din stânga); poziția f1 3 până la a doua bază (C); poziția f1 -1 se leagă de a treia poziție (G); f2 poziția 6 până la a patra bază (T); si asa mai departe.

Interacțiuni

S-a demonstrat că EGR-1 interacționează cu:

Vezi si

Degetul de zinc

Referințe

Lecturi suplimentare

Heath RG (martie 1975). "Funcția și comportamentul creierului. I. Emoția și fenomenele senzoriale la pacienții psihotici și la animalele experimentale". Jurnalul bolilor nervoase și mentale . 160 (3): 159-75. doi : 10.1097 / 00005053-197503000-00002 . PMID 1090709 . S2CID 23024944 .
Silverman ES, Collins T (martie 1999). "Căi ale transcripției genei mediate de Egr-1 în biologia vasculară" . Jurnalul American de Patologie . 154 (3): 665-70. doi : 10.1016 / S0002-9440 (10) 65312-6 . PMC 1866415 . PMID 10079243 .
Adamson ED, Mercola D (2002). "Factorul de transcripție Egr1: roluri multiple în creșterea și supraviețuirea celulelor tumorale de prostată". Biologia tumorală . 23 (2): 93–102. doi : 10.1159 / 000059711 . PMID 12065847 . S2CID 46795197 .
Blaschke F, Bruemmer D, Law RE (august 2004). "Egr-1 este un factor major de transcripție patogenă vasculară în ateroscleroză și restenoză". Recenzii în Tulburări endocrine și metabolice . 5 (3): 249-54. doi : 10.1023 / B: REMD.0000032413.88756.ee . PMID 15211096 . S2CID 11968305 .
Abdulkadir SA (noiembrie 2005). „Mecanisme de tumorigeneză de prostată: roluri pentru factorii de transcripție Nkx3.1 și Egr1”. Analele Academiei de Științe din New York . 1059 : 33–40. doi : 10.1196 / annals.1339.018 . PMID 16382041 . S2CID 6774788 .
Khachigian LM (februarie 2006). „Răspunsul precoce de creștere-1 în patobiologia cardiovasculară” . Cercetarea circulației . 98 (2): 186–91. doi : 10.1161 / 01.RES.0000200177.53882.c3 . PMID 16456111 .

linkuri externe

Zif + 268 + proteine, + umane la Biblioteca Națională de Medicină din SUA Titlurile subiectului medical (MeSH)
FactorBook Egr -1
Prezentare generală a tuturor informațiilor structurale disponibile în PDB pentru UniProt : P18146 (Human Early response response protein 1) la PDBe-KB .
Prezentare generală a tuturor informațiilor structurale disponibile în PDB pentru UniProt : P08046 (Proteina de răspuns de creștere timpurie a șoarecelui 1) la PDBe-KB .

Languages

In other projects