Ligază - Ligase

Acest articol este despre ligasele generale. Pentru ligazele specifice ADN-ului, a se vedea ADN ligaza .

În biochimie , o ligază este o enzimă care poate cataliza îmbinarea ( ligarea ) a două molecule mari prin formarea unei noi legături chimice . Acest lucru este de obicei prin hidroliza unei mici grupe chimice pandantive pe una dintre moleculele mai mari sau enzima care catalizează legătura între doi compuși, de exemplu, enzime care catalizează unirea CO, CS, CN etc. În general, o ligază catalizează următoarea reacție:

Ab + C → A – C + b

sau uneori

Ab + cD → A – D + b + c + d + e + f

unde literele mici pot însemna grupurile mici, dependente. Ligaza poate uni două fragmente complementare de acid nucleic și poate repara pauzele monocatenare care apar în ADN dublu catenar în timpul replicării.

Nomenclatură

Denumirile comune ale ligazelor includ adesea cuvântul „ligază”, cum ar fi ADN ligaza , o enzimă utilizată în mod obișnuit în laboratoarele de biologie moleculară pentru a uni fragmente de ADN . Alte denumiri comune pentru ligase includ cuvântul „sintetază”, deoarece sunt folosite pentru a sintetiza molecule noi.

Nomenclatura biochimică a deosebit uneori sintetazele de sintaze și uneori a tratat cuvintele ca sinonime . Sub o definitie, sintetaze nu folosesc energia de nucleozid trifosfați (cum ar fi ATP, GTP, CTP, TTP și UTP), în timp ce sintetaze face uz nucleozid trifosfați. Se spune, de asemenea, că o sintază este o liasă (o liază este o enzimă care catalizează ruperea diferitelor legături chimice prin alte mijloace decât hidroliza și oxidarea, formând adesea o nouă legătură dublă sau o nouă structură inelară) și nu necesită energie , întrucât o sintetază este o ligază (o ligază este o enzimă care leagă două substanțe chimice sau compuși) și, prin urmare, necesită energie. Cu toate acestea, Comisia mixtă pentru nomenclatura biochimică (JCBN) dictează că "sintaza" poate fi utilizată cu orice enzimă care catalizează sinteza (indiferent dacă folosește sau nu nucleozide trifosfați), în timp ce "sintetaza" trebuie utilizată sinonim.

Clasificare

Ligazele sunt clasificate ca EC 6 în clasificarea numărului CE al enzimelor. Ligazele pot fi clasificate în continuare în șase subclase:

Ligazele asociate membranei

Unele ligase se asociază cu membranele biologice ca proteine ​​de membrană periferică sau ancorate printr-o singură helică transmembranară , de exemplu anumite proteine ​​legate de ubiquitin ligază .

Etimologie și pronunție

Cuvântul ligază folosește forme combinate de lig- (de la verbul latin ligāre , „a lega” sau „a lega împreună”) + -ază (denotând o enzimă), producând „enzimă de legare”.

Vezi si

Referințe