ARN ribozomal 23S - 23S ribosomal RNA
| ARN ribozomal 23S și 5S | |
|---|---|
 ARNr-uri 23S și 5S care indică numere de nucleotide, numere de helix și domenii
| |
| Identificatori | |
| Alte date | |
| De tip ARN | Gene ; ARNr |
| Domenii | Bacterii |
| ASA DE | SO: 0001263 |
| Structuri PDB | PDBe |
23S ARNr este o 2.904 nucleotidă lungă (în E. coli ) , component al subunității mari ( 50S ) a ribozomului bacterian / archean și alcătuiește centrul peptidil - transferazei (PTC). ARNr 23S este împărțit în șase domenii structurale secundare intitulate I-VI, cu ARNr 5S corespunzător fiind considerat domeniul VII. Activitatea peptidil transferazei ribozomale rezidă în domeniul V al acestui ARNr, care este, de asemenea, cel mai comun site de legare pentru antibiotice care inhibă translația, făcându-l o țintă pentru ingineria ribozomală. Un membru bine-cunoscut al acestei clase de antibiotice, cloramfenicolul , acționează prin inhibarea formării legăturii peptidice, cu studii structurale recente 3D care arată două situri de legare diferite în funcție de specia ribozomului. Numeroase mutații în domeniile ARNr 23S cu activitate de peptidil transferază au dus la rezistență la antibiotice. Genele ARNr 23S au de obicei variații mai mari ale secvenței, inclusiv inserții și / sau deleții, comparativ cu alte ARNr.
Omologul eucariot al ARNr 23S LSU este ARN ribozomal 28S , cu o regiune umplută de ARN ribozomal 5.8S .
Funcții de ARNr 23S
În general, ARNr are o funcție esențială a peptidil transferazei. Nucleul stimulant al ribozomului joacă un rol în configurația legăturii peptidice. Atât peptidil-ARNt, cât și aminoacil-ARNt sunt importante pentru sinteza proteinelor și răspunsul la transpeptidare. Cu toate acestea, pozițiile ARNr 23S (G2252, A2451, U2506 și U2585) au o funcție semnificativă pentru legarea ARNt în locul P al subunității ribozomale mari. Aceste nucleotide de modificare din situsul P pot inhiba legarea peptidil-ARNt. Modificarea U2555 poate interveni, de asemenea, cu transferul peptidil-ARNt la puromicină. Mai mult, modificarea chimică a jumătății acestor poziții G2251, G2253, A2439 și U2584 nu poate împiedica legarea ARNt. Peptidil-ARNt al subunităților 50S care se leagă de situsul P păstrează opt poziții ale ARNr 23S din modificarea chimică. Pe de altă parte, mutația în ARNr 23S poate avea, de asemenea, efecte asupra creșterii celulare. Mutațiile A1912G, A1919G și Ψ1917C au fenotipuri puternice de creștere și împiedică translația, în timp ce mutația A1916G are un fenotip de creștere simplu și duce la defecte în subunitățile 50S.
Vezi si
Referințe
linkuri externe
- Pagina pentru 23S_ribosomal_RNA la Rfam
- Intrare pseudobază pentru pseudocnot al ARN ribozomal 23S (PKB00148)
 |
Acest articol de biologie moleculară sau celulară este un butuc . Puteți ajuta Wikipedia extinzându-l . |