Site cu etichetare secvențială - Sequence-tagged site

Un situs marcat cu secvență (sau STS ) este o secvență ADN scurtă (200 - 500 perechi de baze) care are o singură apariție în genom și a cărei locație și secvență de bază sunt cunoscute.

folosire

STS-urile pot fi detectate cu ușurință prin reacția în lanț a polimerazei (PCR) folosind primeri specifici . Din acest motiv, sunt utile pentru construirea hărților genetice și fizice din datele de secvență raportate din multe laboratoare diferite. Ele servesc ca repere pe dezvoltarea hărții fizice a unui genom.

Când locii STS conțin polimorfisme genetice (de exemplu, polimorfisme simple cu lungime de secvență, SSLPs , polimorfisme cu un singur nucleotid), devin markeri genetici valoroși, adică loci care pot fi folosiți pentru a distinge indivizii.

Acestea sunt utilizate în secvențarea cu pușca , în special pentru a ajuta la asamblarea secvențelor .

STS sunt foarte utile pentru detectarea microdelecțiilor în unele gene. De exemplu, unele STS pot fi utilizate în screeningul de PCR pentru a detecta microdelecții în genele Azoospermiei (AZF) la bărbații infertili .

Referințe

linkuri externe

Vezi si