PTPN22 - PTPN22

PTPN22
Structuri disponibile
PDB	Căutare Ortholog : PDBe RCSB
Lista codurilor de identificare PDB
	2P6X , 2QCJ , 2QCT , 3BRH , 3H2X , 3OLR , 3OMH , 4J51
Identificatori
Aliasuri	PTPN22 , proteină tirozin fosfatază, non-receptor tip 22 (limfoid), LYP, LYP1, LYP2, PEP, PTPN8, proteină tirozin fosfatază, non-receptor tip 22, PTPN22.6, PTPN22.5, proteină tirozin fosfatază tip non-receptor 22
ID-uri externe	OMIM : 600716 MGI : 107170 HomoloGene : 7498 GeneCards : PTPN22
Localizarea genei ( uman )
Chr.	Cromozomul 1 (uman)
Sfârșit	113.871.753 bp
Localizarea genei ( mouse-ul )
Chr.	Cromozomul 3 (mouse)
Sfârșit	103.912.247 bp
Model de expresie ARN
	; ; ; ;
	Mai multe date de expresie de referință
Ontologia genică
Funcția moleculară	• fosfoproteină fosfataza activitate ; • SH3 domeniul de legare ; • Activitatea fosfatazei ; • kinazei legare ; • GO: legarea de proteine 0001948 ; • activitate de hidrolază ; • ubiquitin proteina de legare a ligazei ; • activitatea protein tirozin fosfatazei ;
Componentă celulară	• citoplasmă ; • regiunea perinucleară a citoplasmei ; • latura citoplasmatică a membranei plasmatice ; • nucleul celular ; • citosol ;
Proces biologic	• reglarea pozitivă a ubiquitinării proteinei K63 ; • reglarea semnalizării NIK / NF-kappaB ; • reglarea răspunsului imun înnăscut ; • reglarea proliferării naturale a celulelor ucigașe ; • reglarea pozitivă a căii de semnalizare a receptorului de tip toll ; • reglarea căii de semnalizare a receptorilor celulelor T ; • reglarea căii de semnalizare a receptorilor celulelor B ; • defosforilarea fosfoandandamidei ; • procesul sistemului imunitar ; • reglarea negativă a domeniului oligomerizării care leagă nucleotidele conținând 2 căi de semnalizare ; • reglarea negativă a cascadei p38MAPK ; • defosforilarea proteinelor ; • reglarea negativă a expresiei genice ; • reglarea negativă a receptorului celulelor T cale de semnalizare ; • răspuns celular la muramil dipeptidă ; • autofagie ; • răspuns la lipopolizaharidă ; • diferențierea celulelor T ; • reglarea pozitivă a expresiei genice ; • reglarea pozitivă a cascadei ERK1 și ERK2 ; • reglarea pozitivă a receptorului de tip toll 4 cale de semnalizare ; • reglarea negativă a factorului de necroză tumorală productio n ; • reglarea negativă a autofagiei ; • reglarea negativă a activității kinazei JUN ; • reglarea negativă a activării celulelor T ; • reglarea pozitivă a producției de interferon de tip I ; • calea de semnalizare mediată de lipopolizaharide ; • defosforilarea ; • defosforilarea peptidil-tirozinei ; • Calea de semnalizare a receptorilor celulelor T ;
	Surse: Amigo / QuickGO
Orthologs
	26191
	19260
	ENSG00000134242
	ENSMUSG00000027843
	Q9Y2R2
	P29352
	NM_001193431 ; NM_001308297 ; NM_012411 ; NM_015967
	NM_008979
	NP_001180360 ; NP_001295226 ; NP_036543 ; NP_057051
	NP_033005
	Wikidata
Vizualizare / Editare umană	Vizualizați / Editați mouse-ul

Proteina tirozin fosfatază, fără receptor de tip 22 (limfoid) , cunoscută și sub numele de PTPN22 , este o proteină care la om este codificată de gena PTPN22 . Această genă poate fi exprimată în diferite forme . PTPN22 afectează receptivitatea receptorilor celulelor T și B, iar mutațiile sunt asociate cu creșteri sau scăderi ale riscurilor de boli autoimune.

Biologie moleculara

Gena este situată pe brațul scurt al cromozomilor 1 lângă centromere (1p13.2) pe (minus) Crick catena . Are o lungime de 57.898 baze și codifică o proteină de 807 aminoacizi (greutate moleculară 91.705 Da). Există 24 de exoni în genă și sunt cunoscute 21 de variante de transcriere care codifică 10 proteine distincte. Proteinele sunt localizate în citoplasmă .

Funcţie

Această genă codifică o proteină tirozin fosfatază care este exprimată în principal în țesuturile limfoide . Această enzimă este implicată în mai multe căi de semnalizare asociate cu răspunsul imun. Pe baza modelelor de fosfatază murină, identificare structurală și genetică umană, fosfataza formează complexe cu tirozin kinaza C-src (Csk), asociată cu controlul membrilor familiei Src. Mutația Arg620Trp întrerupe legarea la Csk, modifică receptivitatea receptorilor celulelor T și B și este asociată cu boli autoimune. Există alte sugestii că fosfataza reglează funcția CBL în calea de semnalizare a receptorilor celulelor T. Sunt posibile și alte interacțiuni.

Asocierea bolilor

Polimorfismul comun sinonim cu un singur nucleotid Arg620Trp 1858T (rs2476601) localizat în gena PTPN22 a fost asociat cu tulburări autoimune, inclusiv un risc crescut de diabet de tip 1 , artrită reumatoidă , lupus , Vitiligo și boala Graves , dar un risc scăzut de boală Crohn .

Un studiu recent sugerează că mutația nu reduce, pe baza populației, durata de viață. Mutația poate fi conservată în evoluția umană, deoarece poate oferi un răspuns hiper-imun la bolile infecțioase.

Mutațiile în PTPN22 sunt supra-reprezentate în cancerul de sân .

Referințe

Lecturi suplimentare

Gregersen PK (2005). „Căi către identificarea genelor în artrita reumatoidă: PTPN22 și dincolo”. Immunol. Rev . 204 : 74-86. doi : 10.1111 / j.0105-2896.2005.00243.x . PMID 15790351 . S2CID 30275010 .
Marca O, Gough S, Heward J (2005). "HLA, CTLA-4 și PTPN22: cheia genetică comună pentru autoimunitate?". Expert Rev Mol Med . 7 (23): 1-15. doi : 10.1017 / S1462399405009981 . PMID 16229750 .
Bottini N, Vang T, Cucca F, Mustelin T (2006). "Rolul PTPN22 în diabetul de tip 1 și alte boli autoimune". Semin. Immunol . 18 (4): 207-13. doi : 10.1016 / j.smim.2006.03.008 . PMID 16697661 .
Gjörloff-Wingren, A .; Saxena, M .; Han, S .; Wang, X .; Alonso, A .; Renedo, M .; Oh, P .; Williams, S .; Schnitzer, J .; Mustelin, T. (2000). "Localizarea subcelulară a proteinelor intracelulare tirozin fosfataze în celulele T". Jurnalul European de Imunologie . 30 (8): 2412–2421. doi : 10.1002 / 1521-4141 (2000) 30: 8 <2412 :: AID-IMMU2412> 3.0.CO; 2-J . PMID 10940933 .
Hill RJ, Zozulya S, Lu YL, Ward K, Gishizky M, Jallal B (2002). "Proteina limfoidă tirozin fosfatază Lyp interacționează cu molecula adaptor Grb2 și funcționează ca un regulator negativ al activării celulelor T". Exp. Hematol . 30 (3): 237-44. doi : 10.1016 / S0301-472X (01) 00794-9 . PMID 11882361 .
Chien W, Tidow N, Williamson EA, Shih LY, Krug U, Kettenbach A, Fermin AC, Roifman CM, Koeffler HP (2003). "Caracterizarea unei fosfataze tirozin mieloide, Lyp, și rolul său în calea de transducție a semnalului Bcr-Abl" . J. Biol. Chem . 278 (30): 27413-20. doi : 10.1074 / jbc.M304575200 . PMID 12764153 .
Bottini N, Musumeci L, Alonso A, Rahmouni S, Nika K, Rostamkhani M, MacMurray J, Meloni GF, Lucarelli P, Pellecchia M, Eisenbarth GS, Comings D, Mustelin T (2004). „O variantă funcțională a tirozin fosfatazei limfoide este asociată cu diabetul de tip I” . Nat. Genet . 36 (4): 337-8. doi : 10.1038 / ng1323 . PMID 15004560 .
Begovich AB, Carlton VE, Honigberg LA, Schrodi SJ, Chokkalingam AP, Alexander HC, Ardlie KG, Huang Q, Smith AM, Spoerke JM, Conn MT, Chang M, Chang SY, Saiki RK, Catanese JJ, Leong DU, Garcia VE , McAllister LB, Jeffery DA, Lee AT, Batliwalla F, Remmers E, Criswell LA, Seldin MF, Kastner DL, Amos CI, Sninsky JJ, Gregersen PK (2004). "Un polimorfism cu un singur nucleotid missense într-o genă care codifică o proteină tirozin fosfatază (PTPN22) este asociată cu artrita reumatoidă" . A.m. J. Hum. Genet . 75 (2): 330-7. doi : 10.1086 / 422827 . PMC 1216068 . PMID 15208781 .
Kyogoku C, CD Langefeld, Ortmann WA, Lee A, Selby S, Carlton VE, Chang M, Ramos P, Baechler EC, Batliwalla FM, Novitzke J, Williams AH, Gillett C, Rodine P, Graham RR, Ardlie KG, Gaffney PM , Moser KL, Petri M, Begovich AB, Gregersen PK, Behrens TW (2004). "Asocierea genetică a polimorfismului R620W al proteinei tirozin fosfatazei PTPN22 cu LES uman" . A.m. J. Hum. Genet . 75 (3): 504-7. doi : 10.1086 / 423790 . PMC 1182029 . PMID 15273934 .
Smyth D, Cooper JD, Collins JE, Heward JM, Franklyn JA, Howson JM, Vella A, Nutland S, Rance HE, Maier L, Barratt BJ, Guja C, Ionescu-Tîrgoviste C, Savage DA, Dunger DB, Widmer B, Strachan DP, Ring SM, Walker N, Clayton DG, Twells RC, Gough SC, Todd JA (2004). "Replicarea unei asocieri între locusul limfoid al tirozinei fosfatazei (LYP / PTPN22) cu diabetul de tip 1 și dovezi pentru rolul său ca locus autoimunitar general" . Diabet . 53 (11): 3020-3. doi : 10.2337 / diabet.53.11.3020 . PMID 15504986 .
Ladner MB, Bottini N, Valdes AM, Noble JA (2005). "Asocierea polimorfismului nucleotidic unic C1858T al genei PTPN22 cu diabet de tip 1". Zumzet. Immunol . 66 (1): 60-4. doi : 10.1016 / j.humimm.2004.09.016 . PMID 15620463 .
Orozco G, Sánchez E, González-Gay MA, López-Nevot MA, Torres B, Cáliz R, Ortego-Centeno N, Jiménez-Alonso J, Pascual-Salcedo D, Balsa A, de Pablo R, Nuñez-Roldan A, González -Escribano MF, Martín J (ianuarie 2005). "Asocierea unui polimorfism funcțional unic-nucleotidic al PTPN22, care codifică fosfataza proteinelor limfoide, cu artrită reumatoidă și lupus eritematos sistemic" . Artrita reumatică . 52 (1): 219-24. doi : 10.1002 / art.20771 . PMID 15641066 .
Steer S, Lad B, Grumley JA, Kingsley GH, Fisher SA (2005). „Asocierea R602W într-o genă de proteină tirozin fosfatază cu un risc ridicat de poliartrită reumatoidă la o populație britanică: dovezi pentru un debut precoce / efectul severității bolii” . Artrita reumatică . 52 (1): 358-60. doi : 10.1002 / art.20737 . PMID 15641088 .
Zheng W, She JX (2005). „Asocierea genetică între o limfoidă tirozin fosfatază (PTPN22) și diabetul de tip 1” . Diabet . 54 (3): 906-8. doi : 10.2337 / diabet.54.3.906 . PMID 15734872 .
Zhernakova A, Eerligh P, Wijmenga C, Barrera P, Roep BO, Koeleman BP (2005). „Asocierea diferențială a variantei de codificare PTPN22 cu bolile autoimune la o populație olandeză” . Gene imune . 6 (6): 459-61. doi : 10.1038 / sj.gene.6364220 . PMID 15875058 .

linkuri externe

Prezentare generală a tuturor informațiilor structurale disponibile în PDB pentru UniProt : Q9Y2R2 (tirozină-proteină fosfatază fără receptor tip 22) la PDBe-KB .

Languages

In other projects