Cromozomul 7 - Chromosome 7

Cromozomul 7
Cariotipul masculin uman de înaltă rezoluție - Cromozomul 7 decupat.png
Human cromozomului 7 perechi după G-banding .
Unul este de la mamă, unul este de la tată.
Cariotipul masculin uman de înaltă rezoluție - Cromozomul 7.png
Cromozomul 7 pereche
în cariograma masculină umană .
Caracteristici
Lungime ( bp ) 159.345.973 bp
( GRCh38 )
Numărul de gene 862 ( CCDS )
Tip Autosom
Poziția centromerului Submetacentric
(60,1 Mbp)
Lista completă de gene
CCDS Lista genelor
HGNC Lista genelor
UniProt Lista genelor
NCBI Lista genelor
Vizualizatori externi de hărți
Ensemble Cromozomul 7
Entrez Cromozomul 7
NCBI Cromozomul 7
UCSC Cromozomul 7
Secvențe complete de ADN
RefSeq NC_000007 ( FASTA )
GenBank CM000669 ( FASTA )

Cromozomul 7 este una dintre cele 23 de perechi de cromozomi la om , care au în mod normal două copii ale acestui cromozom. Cromozomul 7 se întinde pe aproximativ 159 milioane de perechi de baze (materialul de construcție al ADN-ului ) și reprezintă între 5 și 5,5% din ADN-ul total din celule .

Genele

Numărul de gene

Următoarele sunt câteva dintre estimările numărului de gene ale cromozomului uman 7. Deoarece cercetătorii utilizează abordări diferite pentru adnotarea genomului, predicțiile lor privind numărul de gene de pe fiecare cromozom variază (pentru detalii tehnice, a se vedea predicția genelor ). Printre diverse proiecte, proiectul de colaborare de codificare a secvenței de codificare ( CCDS ) are o strategie extrem de conservatoare. Deci, predicția numărului de gene al CCDS reprezintă o limită inferioară a numărului total de gene care codifică proteinele umane.

Estimat de Gene care codifică proteinele Gene ARN necodificatoare Pseudogene Sursă Data de lansare
CCDS 862 - - 08.09.2016
HGNC 870 245 703 2017-05-12
Ensemble 984 973 889 29.03.2017
UniProt 944 - - 28.02.2018
NCBI 948 905 933 19.05.2017

Lista genelor

Următoarea este o listă parțială a genelor de pe cromozomul uman 7. Pentru lista completă, consultați linkul din infoboxul din dreapta.

  • ACTR3B : proteina 3B legată de actină
  • AEBP1 : Proteina de legare AE 1
  • AGK : enzima de codificare a acilglicerol kinazei mitocondriale
  • AASS : enzimă de codificare semialdehidă sintază alfa-aminoadipică sintază, mitocondrială
  • ARHGEF35 : codifică factorul de schimb al nucleotidelor proteice Rho guanină (GEF) 35
  • BCAP29 : Proteina asociată cu receptorul celulei B 29
  • BCC6 : codificarea carcinomului bazocelular proteic, susceptibilitate la, 6
  • BRAT1 : Activator ATM 1 asociat BRCA1
  • C7orf25 : proteina UPF0415
  • C7orf31 : cromozomul 7 cadru de lectură deschis 31
  • MAP11 : codificare proteină Proteină asociată cu microtubuli 11
  • CALU : Calumenin
  • CDCA7L : proteină asemănătoare ciclului asociată ciclului de diviziune celulară
  • CNOT4 : CCR4-NOT complex de transcriere, subunitatea 4
  • CPED1 : domeniu asemănător caderinei și PC-esterază conținând 1
  • CPVL : carboxipeptidază, asemănătoare vitelogenului
  • CROT : Carnitină Peroxisomală O-octanoyltransferază
  • DDX56 : helicaza DEAD-box 56
  • DMTF1 : Cyclin D care leagă myb ca factorul de transcripție 1
  • ECOP : proteină coamplificată și supraexprimată EGFR
  • EGFR-AS1 : codificând proteina ARN antisens EGFR 1
  • EZH2 : codificarea enzimei histonă-lizină N-metiltransferază pentru histonă h3 lizină 27
  • FAM71F2 : familie cu similaritate de secvență 71 membru F2
  • FAM185A : familie cu asemănare de secvență 185 membru A
  • FAM200A : familie cu similaritate de secvență 200 membru A
  • FBXO24 : F-box doar proteina 24
  • GBAS : secvență amplificată de glioblastom; Omolog de proteine ​​NipSnap 2
  • GET4 : proteina codificatoare GET4
  • GLCCI1 : Proteină transcriptă 1 indusă de glucocorticoizi
  • HPC4 : cancer de prostată, ereditar, 4
  • ICA1 : autoantigen 1 de celule insulare
  • ING3 : inhibitor al proteinei de creștere 3
  • INTS1 : proteina de codificare a subunității complexului integrator 1
  • IQCE : proteina E care conține domeniul IQ
  • KDM7A : codificând proteina lizină demetilază 7A
  • LINC01003 : codifică ARN 1003 lung codificat intergenic neproteic
  • LRRC17 : repetare bogată în leucină care conține proteina 17
  • LSM5 : degradarea ARN-ului nuclear mic și a ARN-ului U6 asociată
  • LUC7L2 : proteină putoasă de legare a ARN-ului asemănătoare Luc7 2
  • MDFIC : Domeniul inhibitor al familiei MyoD care conține
  • METTL2B : proteină asemănătoare metiltransferazei 2B
  • MINDY4 : MINDY lizină 48 deubiquitinază 4
  • MIR96 : microARN 96
  • MOSPD3 : domeniu de spermă mobilă care conține 3
  • MTERF : factorul de terminare a transcripției mitocondriale 1
  • NOM1 : proteină nucleolară cu domeniul 1 MIF4G
  • NUDCD3 : proteina 3 care conține domeniu NudC
  • NUPL2 : nucleoporin -like 2
  • NXPH1 : neurexofilină-1
  • PDAP1 : proteina 1 asociată cu PDGFA
  • PHTF2 : factor putativ de transcriere a domeniului homeodominic 2
  • PLOD3 : procolagen-lizină, 2-oxoglutarat 5-dioxigenază 3
  • POM121 : POM121 nucleoporină transmembranară
  • POP7 : subunitatea proteinei ribonuclează P p20
  • PPP1R17 : subunitatea de reglare a proteinei fosfatazei 1 17
  • PSPH : fosfoserină fosfatază
  • PURB : proteina B de legare a elementelor bogate în purină
  • PVRIG : proteine ​​care codifică domeniul imunoglobulinei legate de receptorul Poliovirusului
  • RADIL : proteină care conține domenii care asociază rasul și se diluează
  • RCP9 : subunitatea RCP9 a ARN polimerazei III direcționată către ADN
  • REPIN1 : inițiator de replicare 1
  • RNF216-IT1 : proteina de codificare RNF216 transcript intronic 1
  • SCIN : scinderin
  • SCRN1 : secernin 1
  • SOSTDC1 : domeniul sclerostinei care conține 1
  • SPDYE1 : rapid / membru al familiei regulatorului ciclului celular RINGO E1
  • SSC4D : membru al familiei bogat în cisteină, receptor cu scavenger, cu 4 domenii
  • STEAP1 : șase antigene epiteliale transmembranare ale prostatei 1
  • STEAP2 : șase antigene epiteliale transmembranare ale prostatei 2
  • STEAP4 : șase antigene epiteliale transmembranare ale prostatei 4
  • STYXL1 : proteină asemănătoare interacțiunii cu serină / treonină / tirozină 1
  • SUMF2 : factor 2 de modificare a sulatazei
  • SYPL1 : proteină asemănătoare sinaptofizinei 1
  • TARP : proteină cadru de lectură alternativă gamma TCR
  • TBRG4 : factor de creștere transformator beta regulator 4
  • TECPR1 care codifică proteina Tectonin beta-elice repetată conținând 1
  • TMED4 : proteină cu conținut de domeniu emp24 transmembranar 4
  • TMEM130 : proteină transmembranară 130
  • TMEM196 care codifică proteina Proteina transmembranară 196
  • TRBC1 care codifică constanta beta a receptorului de celule T proteină 1
  • TRBC2 care codifică constanta beta a receptorului de celule T proteină 2
  • TRIL : interactor TRL4 cu repetări bogate în leucină
  • URG4 : gena 4 reglată în sus
  • WBSCR17 : polipeptidă N-acetilgalactozaminiltransferază 17
  • WDR91 care codifică domeniul 91 de repetare a proteinei WD
  • WEE2-AS1 : codificare proteină ARN antisens WEE2 1
  • ZC3HAV1 : deget de zinc de tip CCCH
  • ZC3HC1 : deget de zinc de tip C3HC care conține 1
  • ZKSCAN1 : proteină deget de zinc cu domenii KRAB și SCAN 1
  • ZKSCAN5 : proteină deget de zinc cu domenii KRAB și SCAN 5
  • ZMIZ2 : proteină 2 care conține domeniu MIZ deget de zinc
  • ZNF277P : proteină deget de zinc 277
  • ZNF394 : proteină de deget de zinc 394
  • ZNF398 : proteină deget de zinc 398
  • ZNF727 : codificare proteină Proteină de deget de zinc 727
  • ZNF786 : codificare proteină Proteină de deget de zinc 786
  • ZRF1 : familia C2 a familiei de proteine ​​șoc termic DnaJ (Hsp40)
  • ZSCAN21 : degetul de zinc și proteina care conține domeniul SCAN 21

Boli și tulburări

Următoarele boli sunt unele dintre cele legate de genele cromozomului 7:

Tulburări cromozomiale

Următoarele condiții sunt cauzate de modificări în structura sau numărul de copii ale cromozomului 7:

  • Sindromul Williams este cauzat de ștergerea materialului genetic dintr-o porțiune a brațului lung (q) al cromozomului 7. Regiunea ștearsă, care se află la poziția 11.23 (scrisă ca 7q11.23), este desemnată ca regiune critică a sindromului Williams . Această regiune include mai mult de 20 de gene, iar cercetătorii cred că trăsăturile caracteristice ale sindromului Williams sunt probabil legate de pierderea mai multor gene în această regiune.

În timp ce câteva dintre genele specifice legate de sindromul Williams au fost identificate, relația dintre majoritatea genelor din regiunea eliminată și semnele și simptomele sindromului Williams este necunoscută.

  • Alte modificări ale numărului sau structurii cromozomului 7 pot determina întârzierea creșterii și dezvoltării, tulburări mentale, trăsături faciale caracteristice, anomalii scheletice, vorbire întârziată și alte probleme medicale. Aceste modificări includ o copie suplimentară a unei părți a cromozomului 7 în fiecare celulă ( trisomia parțială 7) sau un segment lipsă al cromozomului din fiecare celulă ( monozomia parțială 7). În unele cazuri, mai multe blocuri de construcție ADN ( nucleotide ) sunt șterse sau duplicate în parte a cromozomului 7. Este posibilă și o structură circulară numită cromozomul inelar 7. Un cromozom inelar apare atunci când ambele capete ale unui cromozom rupt sunt reunite.

Banda citogenetica

Ideogramele de bandă G ale cromozomului uman 7
Ideograma cu bandă G a cromozomului 7 uman în rezoluție 850 bphs. Lungimea benzii din această diagramă este proporțională cu lungimea perechii de baze. Acest tip de ideogramă este utilizat în general în browserele de genom (de exemplu Ensembl , UCSC Genome Browser ).
Modele de bandă G ale cromozomului 7 uman în trei rezoluții diferite (400, 550 și 850). Lungimea benzii din această diagramă se bazează pe ideogramele din ISCN (2013). Acest tip de ideogramă reprezintă lungimea reală a benzii relative observată la microscop în diferitele momente din timpul procesului mitotic .
Benzile G ale cromozomului 7 uman în rezoluție 850 bphs
Chr. Braţ Grup
Start ISCN

Oprire ISCN
Basepair
începe
Basepair
oprește
Pata Densitate
7 p 22.3 0 227 1 2.800.000 gneg
7 p 22.2 227 397 2.800.001 4.500.000 gpos 25
7 p 22.1 397 610 4.500.001 7.200.000 gneg
7 p 21.3 610 908 7.200.001 13.700.000 gpos 100
7 p 21.2 908 965 13.700.001 16.500.000 gneg
7 p 21.1 965 1121 16.500.001 20.900.000 gpos 100
7 p 15.3 1121 1419 20.900.001 25.500.000 gneg
7 p 15.2 1419 1589 25.500.001 27.900.000 gpos 50
7 p 15.1 1589 1816 27.900.001 28.800.000 gneg
7 p 14.3 1816 1986 28.800.001 34.900.000 gpos 75
7 p 14.2 1986 2043 34.900.001 37.100.000 gneg
7 p 14.1 2043 2327 37.100.001 43.300.000 gpos 75
7 p 13 2327 2639 43.300.001 45.400.000 gneg
7 p 12.3 2639 2838 45.400.001 49.000.000 gpos 75
7 p 12.2 2838 2909 49.000.001 50.500.000 gneg
7 p 12.1 2909 3093 50.500.001 53.900.000 gpos 75
7 p 11.2 3093 3306 53.900.001 58.100.000 gneg
7 p 11.1 3306 3448 58.100.001 60.100.000 acen
7 q 11.1 3448 3689 60.100.001 62.100.000 acen
7 q 11.21 3689 3973 62.100.001 67.500.000 gneg
7 q 11.22 3973 4171 67.500.001 72.700.000 gpos 50
7 q 11.23 4171 4597 72.700.001 77.900.000 gneg
7 q 21.11 4597 4994 77.900.001 86.700.000 gpos 100
7 q 21.12 4994 5108 86.700.001 88.500.000 gneg
7 q 21.13 5108 5292 88.500.001 91.500.000 gpos 75
7 q 21.2 5292 5406 91.500.001 93.300.000 gneg
7 q 21.3 5406 5661 93.300.001 98.400.000 gpos 75
7 q 22.1 5661 6129 98.400.001 104.200.000 gneg
7 q 22.2 6129 6300 104.200.001 104.900.000 gpos 50
7 q 22.3 6300 6470 104.900.001 107.800.000 gneg
7 q 31.1 6470 6683 107.800.001 115.000.000 gpos 75
7 q 31.2 6683 6867 115.000.001 117.700.000 gneg
7 q 31.31 6867 7094 117.700.001 121.400.000 gpos 75
7 q 31.32 7094 7208 121.400.001 124.100.000 gneg
7 q 31.33 7208 7364 124.100.001 127.500.000 gpos 75
7 q 32.1 7364 7449 127.500.001 129.600.000 gneg
7 q 32.2 7449 7576 129.600.001 130.800.000 gpos 25
7 q 32.3 7576 7803 130.800.001 132.900.000 gneg
7 q 33 7803 8031 132.900.001 138.500.000 gpos 50
7 q 34 8031 8371 138.500.001 143.400.000 gneg
7 q 35 8371 8612 143.400.001 148.200.000 gpos 75
7 q 36.1 8612 8910 148.200.001 152.800.000 gneg
7 q 36.2 8910 9080 152.800.001 155.200.000 gpos 25
7 q 36.3 9080 9350 155.200.001 159.345.973 gneg

În cultura populară

Romane

În romanul Performance Anomalies , cercetătorii de la Universitatea Stanford identifică mutațiile din brațul lung (q) al cromozomului 7 ca fiind la baza sistemului nervos accelerat al protagonistului spion Cono, care primește numele de apel Cono 7Q

Referințe

Lecturi suplimentare

  • Rodríguez L, López F, Paisán L, de la Red Mdel M, Ruiz AM, Blanco M, Antelo Cortizas J, Martínez-Frías ML (nov 2002). „Trisomia parțială pură 7q: doi pacienți noi și revizuirea”. American Journal of Medical Genetics . 113 (2): 218-224. doi : 10.1002 / ajmg.10719 . PMID  12407716 .

linkuri externe

  • Institute Naționale de Sănătate. „Cromozomul 7” . Referință la casă genetică . Arhivat din original la 3 august 2004 . Adus 06.05.2017 .
  • „Cromozomul 7” . Arhiva informațiilor despre proiectul genomului uman 1990–2003 . Adus 06.05.2017 .